Током НАТО бомбардовања, у ноћи 2/3. априла 1999, уништено је 5 фондова Архива који су били смештени у згради СМУП-а, од чега четири потпуно, а један делимично. Потпуно су уништени фондови АЈ-453 Савезни друштвени савет за међународне односе, АЈ-451 Савезни друштвени савет за питања друштвеног уређења, АЈ-452 Савезни друштвени савет за привредни развој и економску политику и АЈ-454 Фонд солидарности са несврстаним земљама и земљама у развоју. Делимично је уништен фонд АЈ-455 Авио-сервис савезних органа.
Бројеви потпуно уништених фондова додељени су фондовима који су у међувремену преузети.
| Број фонда |
Назив фонда |
Информативно средство |
Период грађе |
|---|---|---|---|
| 0451 | САВЕЗНИ ДРУШТВЕНИ САВЕТ ЗА ПИТАЊА ДРУШТВЕНОГ УРЕЂЕЊА | popis | 1971-1990. |
| 0452 | SAVEZNI DRUŠTVENI SAVET ZA PRIVREDNI RAZVOJ I EKONOMSKU POLITIKU | popis | 1975-1990. |
| 0453 | SAVEZNI DRUŠTVENI SAVET ZA MEĐUNARODNE ODNOSE | popis | 1975-1990. |
| 0454 | FOND SOLIDARNOSTI SA NESVRSTANIM ZEMLjAMA I ZEMLjAMA U RAZVOJU | popis | 1975-1991. |
| 0455 | AVIO-SERVIS SAVEZNIH ORGANA | popis | 1985-1992. |